Plateforme analyse isotopique - PLI

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La plateforme Ligérienne d’Isotopie (PLI) est l'infrastructure régionale d’analyse isotopique créée en 2021 dans le cadre du programme "Infrastructure de recherche ligérienne" lancé par la région Pays de la Loire en collaboration avec la Commission européenne.

La PLI rassemble les outils analytiques complémentaires (équipements, techniques analytiques, logiciels) et des compétences applicatives complémentaires : isotopie en environnement, authentification, nutrition-santé au CEISAM-Nantes (UMR 6230 CNRS), et isotopie en biologie végétale-agronomie à l'IRHS-Angers (UMR 1345 INRAe).

 

La PLI est intégrée à la plateforme Corsaire, la division métabolomique-fluxomique de Biogenouest. Il convient également de souligner qu'à l'échelle internationale, la PLI entretient des relations étroites avec des plateformes isotopiques à l'étranger : Institute of Science Tokyo (Japon), Caltech (USA) et Australian National University (Australie). Le site de Nantes fait également partie de MétaboHUB, l’infrastructure nationale d'excellence en métabolomique-fluxomique.

Objectifs de la PLI

La PLI a pour objectif de fournir des outils technologiques de pointe et des services en analyse isotopique et démarche isotopomique (analyse de profils et signatures isotopiques à haut débit) aux équipes de recherche académiques et à des partenaires industriels dans les domaines de l’authentification, du végétal, de la santé, de la nutrition, de l’écologie, de l'environnement et du forensique. Elle a pour ambition de développer des méthodes de pointe en isotopomique utilisant la spectrométrie de masse de rapport isotopique (IRMS) et la résonance magnétique nucléaire quantitative (RMNq) afin de relever les défis technologiques rencontrés dans ces domaines.

La nécessité d’expliquer et d’optimiser les processus biologiques ou chimiques se traduit par une demande croissante d’analyses isotopiques composé-spécifiques (CSIA) et/ou position-spécifiques (PSIA) à grande échelle.

Offre de services

Prestations analytiques

  • Analyses isotopiques globales (¹³C, ¹⁵N, ²H, 18O, ³⁴S)
  • Analyses composé-spécifiques 15N et 13C par GC-C-IRMS (acides aminés, acides gras, sucres, acides organiques)
  • Analyses position-spécifiques 2H et 13C par RMN
  • Analyses métabolomiques par GC-MS avec ou sans fragmentation MS/MS

Prestations R&D et développement de méthodes

  • Développement de nouvelles méthodes isotopiques pour des besoins spécifiques
  • Collaboration scientifique sur la conception et l’optimisation de protocoles
  • Interprétation des données isotopiques et conseils pour applications industrielles

Formations et transfert de compétences

  • Formation à l’analyse isotopique et à la manipulation des équipements
  • Séances de formation personnalisées selon le niveau des utilisateurs (académiques ou industriels)
  • Support méthodologique pour l’intégration des données isotopiques dans les projets industriels ou de recherche
  • Transfert méthodologique afin d’implanter chez un client les méthodes d’analyse isotopique position-spécifique par RMN.

Equipements de la plateforme PLI

Site de Nantes : 7 équipements

EA-IRMS Thermo Fischer Scientific

Analyse globale en ¹⁵N et ¹³C

GC-C-IRMS Thermo Fischer Scientific

Analyse composé-spécifique en ¹⁵N et ¹³C
Profilage isotopique des acides gras

Acquisition : 2007
Renouvèlement prévu : 2026

GC-C-IRMS Elementar

Analyse composé-spécifique ¹⁵N et ¹³C
Profilage isotopique des acides aminés

Acquisition : 2022
Renouvèlement prévu : 2042

ISOFLOW Elementar

Analyse en 13C et 18O du CO2 de l’air, de gaz
expirés et de carbonates

Acquisition : 2022
Renouvèlement prévu : 2042

HPLC préparative Shimadzu

Equipée d’un passeur d’échantillons, d’un collecteur de fraction,
d’un DEDL et d’un détecteur UV à barrette de diodes

Acquisition : 2021
Renouvèlement prévu : 2041

RMN 400 MHz QUAD SYSTEMS

Spectre 1H, 2H et 13C
Profilage métabolomique et analyse isotopique position-spécifique par RMN

Acquisition : 2023
Renouvèlement prévu : 2043

Microbalance XP6 Automated-S

METTLER TOLEDO

Précision 10-3 mg
Portée maximale 6,1 g

Acquisition : 2010
Renouvèlement prévu : 2030

Balance de précision PXD235D

OHAUS Pioneer

Précision 10-2 mg, portée maximale 82 g
et précision 10-1 mg, portée maximale 220 g

Acquisition : 2018
Renouvèlement prévu : 2038

Site d’Angers : 6 équipements

EA-IRMS

Elementar

Analyse globale en ¹³C, ²H, 18O, 15N et ³⁴S

Acquisition : 2020
Renouvèlement prévu : 2040

GC-C-IRMS

Elementar

Analyse composé-spécifique en ¹³C et 15N et (acides organiques, sucres, acides aminés)

Acquisition : 2020
Renouvèlement prévu : 2040

ISOFLOW

Elementar

Analyse en 13C et 18O du CO2 de l’air et de carbonates

Acquisition : 2020
Renouvèlement prévu : 2040

GC-MS (Orbitrap)

Thermo Fischer Scientific

Analyses métabolomiques avec ou sans fragmentation MS/MS

Acquisition : 2019
Renouvèlement prévu : 2039

RMN 600 MHz

Bruker

Profilage métabolomique et Analyse isotopique position-spécifique en 13C par RMN

Acquisition : 2024
Renouvèlement prévu : 2044

Microbalance WXTS3DU

Mettler Toledo

Précision 10-3 mg
Portée maximale 3.2 g

Acquisition : 2020
Renouvèlement prévu : 2040

Accès pour les utilisateurs

Modalités d’accès

La PLI est ouverte aux utilisateurs académiques et industriels, internes et externes aux deux sites (Nantes et Angers). L’accès se fait sur la base de projets scientifiques validés, avec une priorisation en fonction de la disponibilité des équipements et de la pertinence scientifique.

Procédure de contact :

Email direct : ceisam_pli@univ-nantes.fr (Nantes) ; julie.lalande@inrae.fr (Angers)

Les demandes sont centralisées et évaluées par les responsables scientifiques et techniques pour définir le plan d’analyse et la faisabilité technique.

Accompagnement des utilisateurs

Chaque projet bénéficie d’un accompagnement personnalisé, assuré par les responsables techniques et scientifiques :

  • Évaluation de la demande et du choix de la méthode adaptée,
  • Suivi de l’échantillon et planification des analyses,
  • Interprétation des résultats et discussion scientifique,
  • Formation à l’utilisation des instruments et aux bonnes pratiques analytiques,
  • Mise en place éventuelle de projets de R&D collaboratifs.

Cette organisation garantit une réponse sous 10 jours ouvrés, un suivi de qualité et une appropriation des résultats par les utilisateurs.